La principal ventaja del FAT32 es que si por lo que sea quisieras tener W98 y XP en un mismo disco,XP leeria FAT32 en particiones logicas,algo que no pasaria con W98 si tuvieses que acceder a un sistema NTFS (Aunque como hay tanto programilla,no se si a dia de hoy es posibleCmOs escribió:wenas de nuevo!
Efectivamente linux solo puede leer ntfs, en cambio, puede leer y escribir sobre particiones fat32.Salu2

En cuanto a mejoras y prestaciones,mejor NTFS,como velocidad,a nivel domestico no notas diferencia,tal vez a nivel profesional,sea mejor un sistema u otro,pero no te aseguro este dato.
Salu2